Proyecto de Investigación Nº 117

El rol de las interacciones genómicas y epigenéticas en híbridos y alopoliploides de Arachis en planes de pre-mejoramiento del maní cultivdao

La presencia de re-arreglos genómicos y epigenéticos que generan la no aditividad de la expresión de los parentales en los poliploides son productos de la hibridación y duplicación cromosómica utilizadas en pre mejoramiento de maní. Como consecuencia, los fenotipos seleccionados en los diploides silvestres pueden perderse en los anfidiploides artificiales y en líneas introgresantes. Se conoce que la magnitud y la dirección de estos cambios están íntimamente relacionadas con la constitución de los genomas que interactúan y con la dirección en que se sintetizan los híbridos. Se han citado, para varios cultivos y poliploides sintéticos, numerosos casos de dominancia nuclear. En este marco, los objetivos del proyecto son analizar el efecto de la hibridación y duplicación cromosómica en el establecimiento de la dominancia nuclear, la magnitud y el sentido en que se produce, e inferir las causas que conducen a la misma en híbridos intergenómicos AB y alopoliploides AABB utilizados en pre-mejoramiento. Para esto, se analizarán la ocurrencia de dominancia nucleolar por TSA-FISH, mediante la conversión génica en los loci ADNr 45S y la metilación diferencial de los mismos. Estos dos últimos aspectos se analizarán por NGS y por tratamiento con bisulfito. Asimismo, se compararan los perfiles transcripcionales de alelos específicos de genomas por RT -qPCR de dos genes de copia simple y se compararán con el estado epigenético de los mismos. Los resultados bridarán información básica para extender el conocimiento sobre interacciones genómicas y será aplicable para seleccionar caracteres agronómicos deseables en materiales silvestres con una constitución genómica que, en los tetraploides de premejoramiento y en líneas introgresantes de maní, tiendan a conservar los patrones de expresión seleccionados.

Director
Chalup, Laura
Codirector
No posee
Email de contacto
laurachalup@gmail.com
Periodo
Desde: 2020-01-01
Hasta: 2023-12-31
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